Santorin est romantiquement liée à l’Atlantide perdue, ce qui signifie que c’est la partie centrale de l’île qui a coulé. Vers 1500 avant JC. est devenu la première majeure éruption volcanique historique. Les habitants de l’île avaient apparemment été avisés plus tôt de quitter l’île ronde et ont ainsi été sauvés de l’explosion.
La mythologie raconte que l’éruption du volcan de Santorin est décrite par le mythe de Phaéthon, fils du Soleil et de Clymen, qui a demandé à son père la permission de conduire son char. Cependant, il n’a pas réussi à contrôler les chevaux, en s’éloignant le char de sa route avec des résultats catastrophiques. Alors Zeus est intervenu et a mis le feu à Phaethon afin qu’il puisse arrêter le char.
